Entwässern
Um von den makroskopisch verarbeiteten Gewebsproben 2-3 Tausendstelmillimeter dünne, am Mikroskop beurteilbare Schnittpräparate anfertigen zu können, muss das Wasser im Gewebe und in den Zellen durch Paraffin ersetzt werden. Dies wird durch aufeinanderfolgende Bäder der Kapseln mit den Gewebsstücken in 70-, 80-, 96- und 100-prozentigem Alkohol, anschliessend in Xylol und schlussendlich in heissem, dünnflüssigem Paraffin erreicht.
Dieser Prozess dauert mehrere Stunden und wird maschinell über Nacht durchgeführt. Ausschliesslich wenige Millimeter grosse Biopsien, z.B. aus dem Magen-Darm-Trakt, können ohne wesentliche Qualitätseinbusse in einem Schnellprogramm während des Tages entwässert werden.


